Ampla colecţie de la Muzeul Muzicii din Lisabona este adăpostită într-un stabiliment mai curând surprinzător, anume, în staţia de metrou Alto dos Moinhos, ocupând două nivele ale aripii vestice a staţiei. Colecţia de instrumente este una dintre cele mai preţuite din Europa, întrucât este una dintre cele mai ample şi mai variate de pe continent, cuprinzând rarităţi şi unicate din toate colţurile lumii (inclusiv Asia, Africa şi Europa), datând cu începere din secolul al XVI-lea. Astfel, atracţiile principale se referă la piese precum un violoncel Stradivari şi la un pian Boisselot et Fils (care a aparţinut pe vremuri lui Franz Liszt).
Lăsând la o parte această impresionantă colecţie de instrumente, vizitatorii pot, de asemenea, să admire o colecţie diversă de fotografii, picturi, opere sculpturale, ceramică şi schiţe, precum şi exponate cu valoare documentară (manuscrise şi materiale tipărite). Aici este disponibilă şi o arhivă audio.